三日香為西港刈香的主軸，共進行三天、範圍遍及96村鄉，由三位千歲爺輪流擔任主巡，奉旨南巡北狩。從「請旨領令」、「拜廟出香」開始，依照路關圖「出巡遶境」，最後回到慶安宮「入廟繳令」。

 

　　每一日香路與蜈蚣陣的裝閣題材都有所不同，三日香也採取「入庄步行、出庄車行」的方式，只有百足真人蜈蚣陣是完全步行。三日香除了刈香遶境的行程外，也包含王醮與送王的儀式。

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　　先說「請王」，自1997年開始，時點都在請媽祖的前一日進行，道士團要先設置法場、焚油淨殿，在南海埔「王船地」舉辦王爺與兵馬的開光儀式，確認王爺等眾神降臨後，恭迎王爺回府安奉。

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　　「王醮」的活動自三日香第一天同步展開，第一天主要的儀式有豎立天旗、懸掛金榜、分燈捲簾、勅水禁壇；第二天燃放水燈，第三天則是登臺拜表、通誠正醮。

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　　送王則在刈香的第三日舉行，包含點艙、關五神燈、拍船醮（祭船）等科儀。送王時會將下錨用的大水缸傾倒潑地，表示潮水已到可以啟航，之後會以鋤頭劃地開水路，並滴灑清水表示潮水迎舟，王船則前往南海埔「王船地」，沿途拋灑金紙，早期為是向沿途的好兄弟借道，現在則提供民眾撿取做為平安符之用。

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　　到了王船地後，王船豎起桅桿、掛起船帆，由五主會分頭點燃金紙，火化王船，被稱為「遊天河」。一系列儀式結束之後，再恭送青龍公保安大帝與鹿耳門天后宮媽祖回廟。